• <samp id="d0fgf"></samp>
    <ruby id="d0fgf"><font id="d0fgf"></font></ruby>
    <ruby id="d0fgf"></ruby>

    <samp id="d0fgf"></samp>

      <dd id="d0fgf"></dd>
    1. <optgroup id="d0fgf"></optgroup><span id="d0fgf"></span><span id="d0fgf"></span>
      <span id="d0fgf"><output id="d0fgf"><b id="d0fgf"></b></output></span>
      這是描述信息
      資訊分類

      甲基化芯片數據的擴展方法與流程

      • 分類:行業新聞
      • 作者:
      • 來源:
      • 發布時間:2022-06-10 10:50
      • 訪問量:

      【概要描述】甲基化芯片是表觀遺傳學中研究較多的修飾形式,也是人類認識早的表觀遺傳學現象之一。 甲基化芯片的變化影響著細胞正常發育過程中基因組轉錄模式的變化,在疾病的發生和發展中起著重要作用,目前我們獲取dna甲基化數據主要是通過實驗方法檢測dna甲基化狀態,這種方法測量數據比較準確,但人力財力費用較大。 因此,用計算方法預測dna甲基化數據顯得尤為重要和重要,那么,下面一起了解下甲基化芯片數據的擴展方法與流程

      甲基化芯片數據的擴展方法與流程

      【概要描述】甲基化芯片是表觀遺傳學中研究較多的修飾形式,也是人類認識早的表觀遺傳學現象之一。 甲基化芯片的變化影響著細胞正常發育過程中基因組轉錄模式的變化,在疾病的發生和發展中起著重要作用,目前我們獲取dna甲基化數據主要是通過實驗方法檢測dna甲基化狀態,這種方法測量數據比較準確,但人力財力費用較大。 因此,用計算方法預測dna甲基化數據顯得尤為重要和重要,那么,下面一起了解下甲基化芯片數據的擴展方法與流程

      • 分類:行業新聞
      • 作者:
      • 來源:
      • 發布時間:2022-06-10 10:50
      • 訪問量:
      詳情

        甲基化芯片是表觀遺傳學中研究較多的修飾形式,也是人類認識早的表觀遺傳學現象之一。 甲基化芯片的變化影響著細胞正常發育過程中基因組轉錄模式的變化,在疾病的發生和發展中起著重要作用,目前我們獲取dna甲基化數據主要是通過實驗方法檢測dna甲基化狀態,這種方法測量數據比較準確,但人力財力費用較大。 因此,用計算方法預測dna甲基化數據顯得尤為重要和重要,那么,下面一起了解下甲基化芯片數據的擴展方法與流程吧!

        甲基化芯片檢測方法常用的方法是亞硫酸鹽序列和亞硫酸鹽微陣列法,全基因組亞硫酸氫鈉序列(wgbs )具有全面的基因組覆蓋,但高序列深度使其非常昂貴。 亞硫酸鹽微陣列方法成本較低,但受制于先驗目標區域,覆蓋的基因組范圍較小。

        甲基化芯片技術實現要素:

        本發明的目的是克服現有技術的不足,提供使用在不同組織中具有類似的局部甲基化芯片模式的cpg部位甲基化值和相鄰的cpg部位甲基化加權值進行建模和擴展的dna甲基化芯片數據的擴展方法,從而實現上述發明的目的

        1、提取數據

        從甲基化芯片通用數據庫geo中獲取31種不同組織的t1.t2.t31全基因組亞硫酸鹽測序數據和31種組織相應的dna甲基化芯片數據; 另外,從該數據庫中取得與上述31種組織不同其他任意組織t32的全部基因組亞硫酸鹽測序的數據和dna甲基化芯片的數據;

        2、數據預處理

        分別判斷全基因組亞硫酸氫鹽測序數據和dna甲基化芯片數據各行是否有空值,如有空值則刪除相應行,得到標準全基因組亞硫酸氫鹽測序數據和dna甲基化芯片數據;

        3、特征提取

        假設各組織中有n個相同數量的cpg位點,其中n個位點的甲基化值通過全基因組亞硫酸鹽序列檢測到,n個位點中m個位點同時通過dna甲基化芯片檢測到,則剩下的k個位點通過dna甲基化芯片檢測到將組織t32中的第k (k=1.2.…,k )個芯片未檢測到的部位設為cpgk;在31個組織中找到局部甲基化模式與cpgk位點相似的組織,根據該組織對應cpgk位點的全部基因組亞硫酸順序檢測到的甲基化值以及接近cpgk的2個位點的甲基化加權值和cpgk位點的全部基因組亞硫酸鹽順序。

        4、訓練邏輯回歸模型

        作為logistic回歸模型的輸入,以yk為logistic回歸模型的輸出訓練logistic回歸模型,得到標準的logistic回歸模型

        5、獨立樣本預測

        甲基化芯片獲取任意組織的dna甲基化芯片數據,t1、t2、t31的全部基因組移位測序數據和對應的dna甲基化芯片數據,并通過步驟(2、3 )中描述的方法獲取甲基化值。

        

      關鍵詞:

      掃二維碼用手機看

      這是描述信息

      郵箱:marketing@sz-acegen.com

      官網:http://www.beautybysoraya.com

      地址:深圳市龍崗區立信路43號永昌大廈407-408室

      Copyright ? 2021  |  深圳市艾斯基因科技有限公司 All Rights Reserved.  |   粵ICP備16072881號  |  網站建設:中企動力 龍崗

      青青国产成人久久111网站,99久久免费只有精品国产,久欠精品国国产99国产精20..,日本动漫爆乳动漫H免费,2019NV天堂网在线,桃花视频在线观看免费高清完整版...,桃花视频在线观看高清免费 <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <文本链> <文本链> <文本链> <文本链> <文本链> <文本链>